MacPortsでghostscript、ptexをインストールした。既存の~/texmfの構造に問題があり、インストールが途中で止まってしまった。texmfをリネームし、再インストールする。
UTF-8をデフォルトの文字コードにしたのでSmartDoc出力もUTF-8となるようにSmartDoc.propertiesにlatex2e.encoding=UTF-8を追加する。
LaTeXiTを最新版にし、ptexなどのパス設定を変更、プリアンブルのarticleをjarticleに変更すると数式に日本語が使えるようになった。